生物脫氮除磷過程中，硝化作用的程度往往是生物脫氮的前提，其控制相對比較簡單；反硝化作用是生物脫氮的關鍵，其受諸多因素影響較大，同時反硝化效果也很大程度上影響系統的生化除磷；生物除磷依靠聚磷菌的過量吸磷，通過對剩余污泥的排出來實現除磷，污泥濃度高低對除磷效果影響最大！
1、污泥濃度對硝化影響
影響硝化反應的環境因素有很多包括：PH、溫度、SRT、DO、BOD/TKN、污泥濃度、有毒物質等。實際污水處理廠在工藝的運行中只能對SRT、DO、BOD/TKN、污泥濃度等參數進行控制。
a. 在好氧硝化過程中較高的污泥濃度其硝化細菌的濃度相對較高，因此好氧硝化反應的速率在高污泥濃度條件下較高。
b. 一定污泥泥齡是保證生物污泥中的硝化細菌存在的條件，同時創造良好的硝化細菌生存條件更能提高其在微生物菌群中所占比例，從而提高硝化細菌濃度。高污泥濃度下在厭氧階段會有更多的BOD被消耗，進入好氧階段其BOD/TKN也就相對更低些。
一些研究表明活性污泥中硝化細菌所占的比例，與BOD/TKN呈反比關系。由于硝化菌是一類自養菌，有機基質的濃度并不是它的生長限制因素，但若有機基質濃度過高，會使生長速率較高的異氧菌迅速繁衍，爭奪溶解氧，從而使自養菌的生長緩慢且好氧的硝化菌得不到優勢，結果降低硝化速率。
c. DO值一般是污水處理廠硝化階段的重要重要指標，一般情況下DO值在2mg/L以上。在大多數氧化溝工藝中其溝內平均DO值都很難達到2mg/L，一般維持在1mg/L或更低水平，但其硝化效果仍然良好，分析原因為氧化溝特有的相對較高污泥濃度雖然其溝內DO值較低，但其它有利于硝化的因素增強。
污泥濃度增高，也就增大生物處理池的的有效容積，同時降低了負荷等。從另一角度分析提高污泥濃度其微生物好氧量也相應增加，在同等曝氣量條件下，溶解氧儀顯現出來的數值也應該較低。以上幾點說明提高污泥濃度，生物池中的DO值可適當降低，硝化效果仍可維持良好水平。
d. 為保證活性污泥中硝化細菌的正常生長繁殖，泥齡一般應控制在8天以上。但為了使硝化細菌與其它異氧細菌有相對平衡的生存競爭力，應在污泥不發生嚴重老化前提下提高泥齡，相應也就是增大生物系統的污泥濃度。
2、污泥濃度對反硝化影響
生物反硝化作用即為在缺氧條件下反硝化細菌利用硝酸鹽中的離子氧分解有機物的過程，硝酸鹽即被還原為N2，完成脫氮過程。反硝化過程中的反硝化細菌是大量存在于污水處理系統中的異氧型兼性細菌，在有氧存在條件下，反硝化細菌利用氧進行呼吸、氧化分解有機物。
在無分子氧的條件下，同時存在硝酸和亞硝酸離子時，它們能用這些離子中的氧進行呼吸，使有機質氧化分解。反硝化細菌能夠利用各種各樣的有機基質作為反硝化過程中的電子供體，其中包括：碳水化合物、有機酸類、醇類以及甚至像烷烴類、苯酸鹽類和其它的苯衍生物這些化合物，它們往往是廢水的主要組分。影響反硝化速率的因素較多，包括PH值、溫度、DO、碳氮比、污泥濃度等，實際污水處理廠在工藝的運行中只能對DO、污泥濃度等參數進行控制。碳氮比雖然是反硝化反應中最重要的影響因素但其和來水水質有很大關系一般實際運行中很難控制。
a. 反硝化反應過程中要求在無分子氧存在的條件下反硝化細菌才能利用硝酸鹽及亞硝酸鹽中的離子氧分解有機物。之前提到，高污泥濃度的生物系統在硝化過程中可適當降低溶解氧值，同時保持硝化效果，因此使硝化末端降低溶解氧可以有效的減少硝酸鹽回流液中所攜帶的溶解氧含量，降低分子氧在缺氧區對反硝化進程的影響，提高反硝化菌利用碳源的反硝化能力。
同時高污泥濃度自身內源代謝好氧量也相對較強，可以進一步消耗回流及缺氧段中的溶解氧。再有非常高的污泥濃度會改變混合液的粘滯性，增大擴散阻力，從而也使回流攜帶的溶解氧降低，在一些使用明渠作為回流通道的處理工藝中可以減小回流跌落的充氧量。總之高污濃度對于降低實際工藝運行中反硝化階段的DO值有較大作用。
b. 由于反硝化細菌是異氧型兼性細菌在污水處理系統大量存在，提高系統中的污泥濃度可有效的提高反硝化細菌的濃度。反硝化反應速度與硝酸鹽亞硝酸鹽濃度基本無關，而與反硝化細菌的濃度呈一級反應。
因此在實際工藝運行中高污泥濃度可以縮短反硝化的時間減小缺氧段的有效容積。在缺氧段有效容積一定的件下，高污泥濃度的反硝化反應可以更好的利用有機基質中相對較難降解的有機物作為碳源進行反硝化反應。這一點對于脫氮除磷工藝，尤其C源不足的情況尤為重要。
c. 高污泥濃度其微生物菌膠團直徑相對較大，在硝化反應過程中受溶解氧低的影響，氧的壓力梯度較小，菌膠團內部容易形成缺氧環境從而發生反硝化反應。所以高污泥濃度可以促進同程反硝化。
3、污泥濃度對生物除磷的影響
生物除磷的關鍵點是提高聚磷菌在活性污泥系統中所占比例，同時在系統運行過程中大量增長繁殖，在排出系統時聚磷菌體內含磷量維持在一個較高水平。
為了提高系統中聚磷菌所占活性污泥的比例就要為聚磷菌營造更優越的適合其生長繁殖的環境及水力條件，即工藝流程上有良好的厭氧、好氧環境，厭氧區的環境因素控制對聚磷菌的生長繁殖，以及除磷功能的實現尤為重要。厭氧區的高污泥濃度對于聚磷菌更為有利。
生物除磷的效率與泥齡關系密切，只有在一定泥齡（3天左右）的情況下才能有效的排除過量的磷，實現除磷功能，在進水SS一定的情況下，由于污泥濃度與泥齡為正比關系，所以在超出一定范圍污泥濃度越高對應的除磷效果越差！
a. 保證除磷效率的泥齡下，提高污泥濃度在厭氧區其聚磷菌濃度也相應較高，釋磷的微生物量增多，后續好氧吸磷微生物量也就會相應增加，增大了系統整體的除磷作用。
b. 厭氧區聚磷菌吸收VFA釋磷，同時厭氧區在高污泥濃度的條件下可作為系統的厭氧酸化段，對水中的高分子難降解有機物起到厭氧水解作用，聚磷菌釋磷過程中釋放的能量，可供聚磷菌主動吸收乙酸、H+、等使之形成PHB形式貯存在菌體內，從而促進有機物的酸化過程，提高污水的可生化性增大后續處理過程中的反硝化反應所用碳源。
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